据环境保护部公布的数据显示，严重的污染加剧了水资源稀缺状况。目前，每年中国有约250亿立方米的水因受污染而不能使用，成为用水需求得不到满足和地下水耗竭的部分原因；有240亿立方米超出可补充量的地下水被开采，造成地下水耗竭；470亿立方米未达到质量标准的水被供给居民家庭、工业和农业使用，导致相应的损害成本上升。

　　同时，水稀缺削弱了水体发挥其生态功能的能力。由于取水过量，华北地区一些主要河流连最低的环境和生态流量也不能保证。为补足地表水的供求赤字，华北地区越来越依赖于地下水的抽取，而且抽取量往往超过可持续的水平。这样的过度开采已造成地下水源的迅速耗竭，导致地下水位下降、湖泊和湿地干涸以及很多城市地面沉降。

　　而水稀缺和水污染造成的最大损失，是公众所面临的健康风险。据统计，中国有超过3亿农村居民没有安全的饮用水，农村地区居民因发生腹泻和癌症导致的疾病和过早死亡的经济损失估计为662亿元，约占GDP的0.49%%。

　　据世界银行估计，水危机导致的损失已占到中国GDP的约2.3%%。这样的估算所反映的只是一个局部，并没有包括尚未做出估计的损失，如水体富营养化，湖泊、湿地和河流干涸等的生态影响，以及大多数水体因污染造成的舒适性丧失。这些损失还没有进行估算。

　　世界银行高级环境专家谢剑说：“中国现有许多经济可行的技术方案可用以提高水资源的利用效率，减少水污染，从而促进其水资源问题的解决。但是，由于中国水管理体制薄弱，这些方案的采纳和实施程度很有限。根据世界其他国家的经验，中国应改进各级政府的体制安排，以支持更加广泛地实施这些方案。”

　　世界银行建议，中国应改变传统的水管理制度，改变以部门和地区管辖范围为边界而相互分割的“九龙治水”局面，转向一种新的综合管理模式，加强现有机构间的协调，定期开展部门间的协商，强制要求部门间信息共享，在制定相关政策和计划时实行交叉评议，会签制度及共同制定政策等；改革国家一级政府机构，如成立国家水资源委员会，指导制订国家水战略，审批关于水资源开发、分配和利用的长期规划，协调所有的涉水部门，以避免各部门出台的政策不一致甚至相互冲突等；为流经或跨越不同省市的所有大河大湖建立流域管理委员会，其领导层应既有中央政府也有相关省市政府的代表，确保整个流域水资源管理的责任性适当合理。